Package org.lifstools.jgoslin.domain

Klasse LipidMolecularSpecies

java.lang.Object

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidMolecularSpecies

Bekannte direkte Unterklassen:

LipidSnPosition

public class LipidMolecularSpecies
extends LipidSpecies

Molecular species level according to the 2020 update of the Liebisch shorthand nomenclature.

Autor:

Dominik Kopczynski, Nils Hoffmann

Siehe auch:

• LipidLevel

Feldübersicht

Von Klasse geerbte Felder org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

fa, faList, headGroup, info

Konstruktorübersicht

Konstruktoren

Konstruktor	Beschreibung
LipidMolecularSpecies(Headgroup _headgroup, Collection<FattyAcid> _fa, KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)
LipidMolecularSpecies(Headgroup _headgroup, KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

Methodenübersicht

Modifizierer und Typ	Methode	Beschreibung
String	buildLipidSubspeciesName()
String	buildLipidSubspeciesName(LipidLevel level)
ElementTable	getElements()
LipidLevel	getLipidLevel()
String	getLipidString()	Returns the normalized lipid string on the native level.
String	getLipidString(LipidLevel level)	Returns the normalized lipid string on the provided level.

Von Klasse geerbte Methoden org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

getExtendedClass, getFaList, getHeadGroup, getInfo

Von Klasse geerbte Methoden java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Konstruktordetails

LipidMolecularSpecies

public LipidMolecularSpecies(Headgroup _headgroup,
 KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

LipidMolecularSpecies

public LipidMolecularSpecies(Headgroup _headgroup,
 Collection<FattyAcid> _fa,
 KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

Methodendetails

buildLipidSubspeciesName

public String buildLipidSubspeciesName()

buildLipidSubspeciesName

public String buildLipidSubspeciesName(LipidLevel level)

getLipidLevel

public LipidLevel getLipidLevel()

Setzt außer Kraft:

getLipidLevel in Klasse LipidSpecies

getElements

public ElementTable getElements()

Setzt außer Kraft:

getElements in Klasse LipidSpecies

getLipidString

public String getLipidString()

Beschreibung aus Klasse kopiert: LipidSpecies

Returns the normalized lipid string on the native level.

Setzt außer Kraft:

getLipidString in Klasse LipidSpecies

Gibt zurück:

the normalized lipid string.

getLipidString

public String getLipidString(LipidLevel level)

Beschreibung aus Klasse kopiert: LipidSpecies

Returns the normalized lipid string on the provided level.

Setzt außer Kraft:

getLipidString in Klasse LipidSpecies

Parameter:

level - the lipid level at which the lipid string should be generated.

Gibt zurück:

the normalized lipid string.