Package org.lifstools.jgoslin.domain

Klasse LipidStructureDefined

java.lang.Object

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidMolecularSpecies

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSnPosition

org.lifstools.jgoslin.domain.LipidStructureDefined

Bekannte direkte Unterklassen:

LipidFullStructure

public class LipidStructureDefined
extends LipidSnPosition

Structure defined level according to the 2020 update of the Liebisch shorthand nomenclature.

Autor:

Dominik Kopczynski, Nils Hoffmann

Siehe auch:

• LipidLevel

Feldübersicht

Von Klasse geerbte Felder org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

fa, faList, headGroup, info

Konstruktorübersicht

Konstruktoren

Konstruktor	Beschreibung
LipidStructureDefined(Headgroup _headgroup, Collection<FattyAcid> _fa, KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)
LipidStructureDefined(Headgroup _headgroup, KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

Methodenübersicht

Modifizierer und Typ	Methode	Beschreibung
LipidLevel	getLipidLevel()
String	getLipidString()	Returns the normalized lipid string on the native level.
String	getLipidString(LipidLevel level)	Returns the normalized lipid string on the provided level.

Von Klasse geerbte Methoden org.lifstools.jgoslin.domain.LipidMolecularSpecies

buildLipidSubspeciesName, buildLipidSubspeciesName, getElements

Von Klasse geerbte Methoden org.lifstools.jgoslin.domain.LipidSpecies

getExtendedClass, getFaList, getHeadGroup, getInfo

Von Klasse geerbte Methoden java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Konstruktordetails

LipidStructureDefined

public LipidStructureDefined(Headgroup _headgroup,
 KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

LipidStructureDefined

public LipidStructureDefined(Headgroup _headgroup,
 Collection<FattyAcid> _fa,
 KnownFunctionalGroups knownFunctionalGroups)

Methodendetails

getLipidLevel

public LipidLevel getLipidLevel()

Setzt außer Kraft:

getLipidLevel in Klasse LipidSnPosition

getLipidString

public String getLipidString()

Beschreibung aus Klasse kopiert: LipidSpecies

Returns the normalized lipid string on the native level.

Setzt außer Kraft:

getLipidString in Klasse LipidSnPosition

Gibt zurück:

the normalized lipid string.

getLipidString

public String getLipidString(LipidLevel level)

Beschreibung aus Klasse kopiert: LipidSpecies

Returns the normalized lipid string on the provided level.

Setzt außer Kraft:

getLipidString in Klasse LipidSnPosition

Parameter:

level - the lipid level at which the lipid string should be generated.

Gibt zurück:

the normalized lipid string.