Package org.lifstools.jmzqc

Datensatzklasse MzQC

java.lang.Object
java.lang.Record
org.lifstools.jmzqc.MzQC
public record MzQC(String contactAddress, String contactName, List<ControlledVocabulary> controlledVocabularies, OffsetDateTime creationDate, String description, List<BaseQuality> runQualities, List<BaseQuality> setQualities, String version) extends Record
Root element of an mzQC file.

  • Konstruktordetails

    • MzQC

      public MzQC(String contactAddress, String contactName, List<ControlledVocabulary> controlledVocabularies, OffsetDateTime creationDate, String description, List<BaseQuality> runQualities, List<BaseQuality> setQualities, String version)
      Erstellt eine Instanz einer Datensatzklasse MzQC.
      Parameter:
      contactAddress - Wert für die Datensatzkomponente contactAddress
      contactName - Wert für die Datensatzkomponente contactName
      controlledVocabularies - Wert für die Datensatzkomponente controlledVocabularies
      creationDate - Wert für die Datensatzkomponente creationDate
      description - Wert für die Datensatzkomponente description
      runQualities - Wert für die Datensatzkomponente runQualities
      setQualities - Wert für die Datensatzkomponente setQualities
      version - Wert für die Datensatzkomponente version

  • Methodendetails

    • getRunQualityMetrics

      public List<QualityMetric> getRunQualityMetrics(int index)
      Returns a reference to the internal list of quality metrics for the given run. Modifications are reflected in the object graph.
      Parameter:
      index - the zero-based array index of a run.
      Gibt zurück:
      the underlying list of qc metrics
      Löst aus:
      IllegalArgumentException - if arguments are invalid

    • getRunQualityMetricsByAccession

      public List<QualityMetric> getRunQualityMetricsByAccession(int index, String accession)
      Returns a reference to the internal list of quality metrics for the given run. Modifications are reflected in the object graph.
      Parameter:
      index - the zero-based array index of a run.
      accession - the cv accession for qc metrics to return
      Gibt zurück:
      the underlying list of qc metrics, filtered for accession
      Löst aus:
      IllegalArgumentException - if arguments are invalid

    • toString

      public final String toString()
      Gibt eine Zeichenfolgendarstellung dieser Datensatzklasse zurück. Die Darstellung enthält den Namen der Klasse, gefolgt vom Namen und Wert jeder der Datensatzkomponenten.
      Angegeben von:
      toString in Klasse Record
      Gibt zurück:
      eine Zeichenfolgendarstellung dieses Objekts

    • hashCode

      public final int hashCode()
      Gibt einen Hashcodewert für diese Objekt zurück. Der Wert wird vom Hashcode jeder der Datensatzkomponenten abgeleitet.
      Angegeben von:
      hashCode in Klasse Record
      Gibt zurück:
      ein Hashcodewert für dieses Objekt

    • equals

      public final boolean equals(Object o)
      Gibt an, ob ein anderes Objekt diesem gleich ("equal to") ist. Die Objekte sind gleich, wenn das andere Objekt der gleichen Klasse angehört und alle Datensatzkomponenten gleich sind. Alle Komponenten in dieser Datensatzklasse werden verglichen mit Objects::equals(Object,Object).
      Angegeben von:
      equals in Klasse Record
      Parameter:
      o - das Objekt, mit dem verglichen wird
      Gibt zurück:
      true, wenn dieses Objekt gleich dem Argument o ist, andernfalls false.

    • contactAddress

      public String contactAddress()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente contactAddress zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente contactAddress

    • contactName

      public String contactName()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente contactName zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente contactName

    • controlledVocabularies

      public List<ControlledVocabulary> controlledVocabularies()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente controlledVocabularies zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente controlledVocabularies

    • creationDate

      public OffsetDateTime creationDate()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente creationDate zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente creationDate

    • description

      public String description()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente description zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente description

    • runQualities

      public List<BaseQuality> runQualities()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente runQualities zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente runQualities

    • setQualities

      public List<BaseQuality> setQualities()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente setQualities zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente setQualities

    • version

      public String version()
      Gibt den Wert für die Datensatzkomponente version zurück.
      Gibt zurück:
      Wert der Datensatzkomponente version