Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

org.molgenis, org.molgenis.bbmri, org.molgenis.cbm, org.molgenis.controller, org.molgenis.gids.tools.compare, org.molgenis.gids.tools.convertor, org.molgenis.jaxb, org.molgenis.omx, org.molgenis.omx.auth.db, org.molgenis.omx.core.db, org.molgenis.omx.filter.db, org.molgenis.omx.observ.db, org.molgenis.omx.observ.target.db, org.molgenis.omx.observ.value.db, org.molgenis.omx.plugins, org.molgenis.sampletab, org.molgenis.service, org.molgenis.servlet, org.molgenis.ui

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • org.molgenis.framework.db.AbstractDatabase (implements org.molgenis.framework.db.Database)
    • org.molgenis.framework.db.jpa.JpaDatabase
      • org.molgenis.JpaDatabase
  • org.molgenis.controller.AccessionController
  • org.molgenis.service.AccessionService
  • org.molgenis.jaxb.Address
  • org.molgenis.jaxb.AnnotationAvailabilityProfile
  • org.molgenis.jaxb.AnnotationAvailabilityProfile.ProvidesInformationTo
  • org.molgenis.omx.plugins.BackgroundPlugin.BackgroundModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.bbmri.BbmriToOmxConverter
  • org.molgenis.controller.BoolValueController
  • org.molgenis.service.BoolValueService
  • org.molgenis.controller.CategoricalValueController
  • org.molgenis.service.CategoricalValueService
  • org.molgenis.controller.CategoryController
  • org.molgenis.service.CategoryService
  • org.molgenis.jaxb.CbmNode
  • org.molgenis.jaxb.CbmNode.Protocols
  • org.molgenis.cbm.CbmXmlParser
  • org.molgenis.controller.CharacteristicController
  • org.molgenis.service.CharacteristicService
  • org.molgenis.jaxb.CollectionProtocol
  • org.molgenis.jaxb.CollectionProtocol.Enrolls
  • org.molgenis.jaxb.CollectionProtocol.ResidesAt
  • org.molgenis.omx.plugins.ContactPlugin.ContactModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.gids.tools.convertor.ConvertGidsMain
  • org.molgenis.CsvEntityExporter
  • org.molgenis.DatabaseConfig
  • org.molgenis.controller.DataSetController
  • org.molgenis.service.DataSetService
  • org.molgenis.controller.DateTimeValueController
  • org.molgenis.service.DateTimeValueService
  • org.molgenis.controller.DateValueController
  • org.molgenis.service.DateValueService
  • org.molgenis.controller.DecimalValueController
  • org.molgenis.service.DecimalValueService
  • org.molgenis.jaxb.Diagnosis
  • org.molgenis.controller.EmailValueController
  • org.molgenis.service.EmailValueService
  • org.molgenis.EntitiesImporterImpl (implements org.molgenis.framework.db.EntitiesImporter)
  • org.molgenis.EntitiesValidatorImpl (implements org.molgenis.framework.db.EntitiesValidator)
  • org.molgenis.ExcelEntityExporter
  • javax.servlet.GenericServlet (implements java.io.Serializable, javax.servlet.Servlet, javax.servlet.ServletConfig)
    • javax.servlet.http.HttpServlet
      • org.molgenis.framework.server.MolgenisFrontController (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisService)
        • org.molgenis.servlet.FrontController
  • org.molgenis.omx.plugins.HeaderPlugin.HeaderModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.omx.plugins.HomePlugin.HomeModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.controller.HtmlValueController
  • org.molgenis.service.HtmlValueService
  • org.molgenis.controller.HyperlinkValueController
  • org.molgenis.service.HyperlinkValueService
  • org.molgenis.controller.IndividualController
  • org.molgenis.service.IndividualService
  • org.molgenis.controller.InstituteController
  • org.molgenis.service.InstituteService
  • org.molgenis.controller.IntValueController
  • org.molgenis.service.IntValueService
  • org.molgenis.controller.LongValueController
  • org.molgenis.service.LongValueService
  • org.molgenis.gids.tools.convertor.MakeEntityNameAndIdentifier
  • org.molgenis.gids.tools.convertor.MakeObservableFeature
  • org.molgenis.gids.tools.convertor.MakeObservationTarget
  • org.molgenis.framework.db.MapperDecorator<E> (implements org.molgenis.framework.db.Mapper<E>)
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.AccessionSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.BoolValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.CategoricalValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.CategorySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.CharacteristicSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.DataSetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateTimeValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DecimalValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.EmailValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.HtmlValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.HyperlinkValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.IndividualSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.InstituteSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.IntValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.LongValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisEntitySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisFileSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.MolgenisGroupSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.MolgenisPermissionSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.MolgenisRoleGroupLinkSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.MolgenisRoleSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.MolgenisUserSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservableFeatureSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationSetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationTargetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservedValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyTermSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSourceSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.PersonRoleSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.PersonSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ProtocolSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.RuntimePropertySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.SpeciesSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.StringValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.filter.db.StudyDataRequestSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.TextValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.ValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.XrefValueSecurityDecorator<E>
  • org.molgenis.model.elements.Model (implements java.io.Serializable)
    • org.molgenis.JDBCMetaDatabase
  • org.molgenis.servlet.MolgenisContextListener (implements javax.servlet.ServletContextListener)
  • org.molgenis.MolgenisDatabasePopulator (implements org.springframework.context.ApplicationListener<E>)
    • org.molgenis.omx.WebAppDatabasePopulator
  • org.molgenis.controller.MolgenisFileController
  • org.molgenis.service.MolgenisFileService
  • org.molgenis.framework.server.services.MolgenisGuiService
    • org.molgenis.servlet.GuiService (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisService)
  • org.molgenis.MolgenisOptions (implements java.io.Serializable)
    • org.molgenis.servlet.UsedMolgenisOptions
  • org.molgenis.controller.MrefValueController
  • org.molgenis.service.MrefValueService
  • org.molgenis.omx.plugins.NewsPlugin.NewsModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.jaxb.ObjectFactory
  • org.molgenis.controller.ObservableFeatureController
  • org.molgenis.service.ObservableFeatureService
  • org.molgenis.controller.ObservationSetController
  • org.molgenis.service.ObservationSetService
  • org.molgenis.controller.ObservationTargetController
  • org.molgenis.service.ObservationTargetService
  • org.molgenis.controller.ObservedValueController
  • org.molgenis.service.ObservedValueService
  • org.molgenis.controller.OntologyController
  • org.molgenis.service.OntologyService
  • org.molgenis.controller.OntologyTermController
  • org.molgenis.service.OntologyTermService
  • org.molgenis.jaxb.Organization
    • org.molgenis.jaxb.Institution
  • org.molgenis.controller.PanelController
  • org.molgenis.service.PanelService
  • org.molgenis.controller.PanelSourceController
  • org.molgenis.service.PanelSourceService
  • org.molgenis.jaxb.ParticipantCollectionSummary
  • org.molgenis.jaxb.ParticipantCollectionSummary.IsClassifiedBy
  • org.molgenis.jaxb.ParticipantCollectionSummary.Provides
  • org.molgenis.jaxb.ParticipantCollectionSummary.Receives
  • org.molgenis.jaxb.PatientAgeGroupAtCollection
  • org.molgenis.jaxb.PatientAgeGroupAtCollection.DescribesPatientAge
  • org.molgenis.jaxb.Person
    • org.molgenis.jaxb.SpecimenCollectionContact
  • org.molgenis.controller.PersonController
  • org.molgenis.controller.PersonRoleController
  • org.molgenis.service.PersonRoleService
  • org.molgenis.service.PersonService
  • org.molgenis.jaxb.Preservation
  • org.molgenis.jaxb.Preservation.IsAppliedTo
  • org.molgenis.controller.ProtocolController
  • org.molgenis.service.ProtocolService
  • org.molgenis.jaxb.Race
  • org.molgenis.omx.plugins.ReferencesPlugin.ReferencesModel (implements java.io.Serializable)
  • org.molgenis.controller.RuntimePropertyController
  • org.molgenis.service.RuntimePropertyService
  • org.molgenis.gids.tools.convertor.SampleConverter
  • org.molgenis.sampletab.SampleTabOmxConverter
  • org.molgenis.util.SimpleTree<T> (implements java.io.Serializable, org.molgenis.util.Tree<T>)
    • org.molgenis.framework.ui.SimpleScreenController<MODEL> (implements org.molgenis.framework.ui.ScreenController<MODEL>, java.io.Serializable)
      • org.molgenis.framework.ui.EasyPluginController<M> (implements org.molgenis.framework.ui.ScreenModel, org.molgenis.framework.ui.ScreenView)
        • org.molgenis.omx.auth.ui.SimpleUserLogin
          • org.molgenis.omx.auth.ui.UserLogin
            • org.molgenis.ui.UserLoginPlugin
      • org.molgenis.framework.ui.FormController<E>
        • org.molgenis.ui.CategoryFormController
        • org.molgenis.ui.DataSetFormController
        • org.molgenis.ui.FeatureFormController
        • org.molgenis.ui.MolgenisEntityFormController
        • org.molgenis.ui.MolgenisGroupFormController
        • org.molgenis.ui.MolgenisPermissionFormController
        • org.molgenis.ui.MolgenisRoleGroupLinkFormController
        • org.molgenis.ui.MolgenisUserFormController
        • org.molgenis.ui.ProtocolFormController
        • org.molgenis.ui.RuntimePropertyFormController
        • org.molgenis.ui.StudyDataRequestFormController
        • org.molgenis.ui.ValueFormController
      • org.molgenis.framework.ui.MenuController
        • org.molgenis.ui.AdminMenu
        • org.molgenis.ui.AuthMenu
        • org.molgenis.ui.ConvertersMenu
        • org.molgenis.ui.EntitiesMenu
        • org.molgenis.ui.MainMenu
        • org.molgenis.ui.ManagementMenu
      • org.molgenis.framework.ui.PluginModel<E> (implements org.molgenis.framework.ui.ScreenModel)
        • org.molgenis.omx.plugins.BackgroundPlugin
          • org.molgenis.ui.BackgroundPluginPlugin
        • org.molgenis.cbm.CbmToOmxConverter
          • org.molgenis.ui.ConvertXmlDataPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.ContactPlugin
          • org.molgenis.ui.ContactPluginPlugin
        • org.molgenis.dataexplorer.plugin.DataSetsIndexerPlugin
          • org.molgenis.ui.DataSetsIndexerPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.HeaderPlugin
          • org.molgenis.ui.HeaderPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.HomePlugin
          • org.molgenis.ui.HomePluginPlugin
        • org.molgenis.framework.ui.IframePlugin
          • org.molgenis.dataexplorer.plugin.DataExplorerPlugin
            • org.molgenis.ui.DataExplorerPluginPlugin
          • org.molgenis.omx.plugins.DataSetDeleterPlugin
            • org.molgenis.ui.DataSetDeleterPluginPlugin
          • org.molgenis.entityexplorer.plugin.EntityExplorerPlugin
            • org.molgenis.ui.EntityExplorerPluginPlugin
          • org.molgenis.protocolmanager.plugin.ProtocolManagerPlugin
            • org.molgenis.ui.ProtocolManagerPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.ImportWizardController
          • org.molgenis.ui.UploadWizardPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.NewsPlugin
          • org.molgenis.ui.NewsPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.auth.service.permissionmanagement.PermissionManagementPlugin
          • org.molgenis.ui.PermissionManagementPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.auth.service.persontouser.PersonToUser
          • org.molgenis.ui.UserToPersonPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.ProtocolViewerController
          • org.molgenis.ui.ProtocolViewerControllerPlugin
        • org.molgenis.omx.plugins.ReferencesPlugin
          • org.molgenis.ui.ReferencesPluginPlugin
        • org.molgenis.omx.auth.service.tokenmanager.TokenManager
          • org.molgenis.ui.TokenManagerPluginPlugin
  • org.molgenis.controller.SpeciesController
  • org.molgenis.service.SpeciesService
  • org.molgenis.jaxb.SpecimenAvailabilitySummaryProfile
  • org.molgenis.jaxb.SpecimenAvailabilitySummaryProfile.RestrictsAccessTo
  • org.molgenis.jaxb.SpecimenCollectionSummary
  • org.molgenis.controller.StringValueController
  • org.molgenis.service.StringValueService
  • org.molgenis.controller.StudyDataRequestController
  • org.molgenis.service.StudyDataRequestService
  • org.molgenis.controller.TextValueController
  • org.molgenis.service.TextValueService
  • org.molgenis.gids.tools.compare.Validation_Main
  • org.molgenis.gids.tools.compare.ValidationChecker
  • org.molgenis.gids.tools.compare.ValidationFile
  • org.molgenis.controller.ValueController
  • org.molgenis.service.ValueService
  • org.molgenis.omx.WebAppConfig.RootController
  • org.molgenis.omx.WebAppInitializer (implements org.springframework.web.WebApplicationInitializer)
  • org.springframework.web.servlet.config.annotation.WebMvcConfigurerAdapter (implements org.springframework.web.servlet.config.annotation.WebMvcConfigurer)
    • org.molgenis.omx.WebAppConfig
  • org.molgenis.controller.XrefValueController
  • org.molgenis.service.XrefValueService