Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• org.molgenis.omx.biobankconnect,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.applicationevent,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.mappingmanager,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyannotator,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyindexer,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyservice,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.utils,
• org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • org.molgenis.data.support.AbstractEntity (implements org.molgenis.data.Entity)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree.AbstractOntologyEntity
      • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree.OntologyEntity
      • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree.OntologyTermEntity
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.AbstractOntologyRepository (implements org.molgenis.data.Repository)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.AbstractOntologyQueryRepository (implements org.molgenis.data.Queryable)
      • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.OntologyQueryRepository
      • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.OntologyTermQueryRepository
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.OntologyIndexRepository (implements org.molgenis.data.Countable)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontology.repository.OntologyTermIndexRepository (implements org.molgenis.data.Countable)
  • org.molgenis.data.support.AbstractRepository (implements org.molgenis.data.Repository)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.StoreMappingRepository
  • org.molgenis.ui.wizard.AbstractWizardPage (implements org.molgenis.ui.wizard.WizardPage)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.AlgorithmReportPage
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.ChooseCataloguePage
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.MappingManagerPage
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.OntologyAnnotatorPage
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.OntologyMatcherPage
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.AlgorithmGenerateResponse
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm.AlgorithmGenerator
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm.AlgorithmScriptLibrary
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm.AlgorithmUnitConverter
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm.ApplyAlgorithms
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyannotator.AsyncOntologyAnnotator (implements org.springframework.beans.factory.InitializingBean, org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyannotator.OntologyAnnotator)
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyindexer.AsyncOntologyIndexer (implements org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyindexer.OntologyIndexer)
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.AsyncOntologyMatcher (implements org.springframework.beans.factory.InitializingBean, org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.OntologyMatcher)
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.AsyncOntologyMatcher.OntologyTermContainer
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.BiobankConnectConfig
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.Concept
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.ConceptList
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.ConceptName
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.CurrentUserStatus
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.DateCreated
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.DescriptorName
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.DescriptorRecord
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.DescriptorRecordSet
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.MeshLoader
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.MeshLoaderApp
  • org.molgenis.framework.ui.MolgenisPluginController
    • org.molgenis.ui.wizard.AbstractWizardController
      • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.BiobankConnectController
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.algorithm.AlgorithmEditorController
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.mappingmanager.MappingManagerController
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyindexer.OntologyIndexerController
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyservice.OntologyServiceController
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree.OntologyTreeController
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.NGramMatchingModel
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.OntologyCreator
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.OntologyLoader
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.OntologyLoaderApp
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.OntologyManager
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.OntologyMatcherRequest
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologytree.OntologyRepositoryRegistrator (implements org.springframework.context.ApplicationListener<E>, org.springframework.core.Ordered)
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyservice.OntologyService
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyservice.OntologyServiceBatchResponse
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyservice.OntologyServiceRequest
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.OpalToOmxConvertor
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.PhenoToOmxConvertor
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.applicationevent.SessionExpireListener (implements javax.servlet.http.HttpSessionListener)
  • org.molgenis.util.SimpleTree<T> (implements java.io.Serializable, org.molgenis.util.Tree<T>)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.MeshTerm
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.Term
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.TermComparison (implements java.lang.Comparable<T>)
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.TermList
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.mesh.TreeNumberList
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyannotator.UpdateIndexRequest
  • org.molgenis.ui.wizard.Wizard (implements java.io.Serializable)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.BiobankConnectWizard
  • org.molgenis.omx.biobankconnect.utils.ZipFileUtil

Interface Hierarchy

• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyannotator.OntologyAnnotator
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologyindexer.OntologyIndexer
• org.molgenis.omx.biobankconnect.ontologymatcher.OntologyMatcher

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • org.molgenis.omx.biobankconnect.wizard.CurrentUserStatus.STAGE