Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

org.molgenis.omx, org.molgenis.omx.cart, org.molgenis.omx.converters, org.molgenis.omx.core, org.molgenis.omx.core.db, org.molgenis.omx.core.ui, org.molgenis.omx.dataset, org.molgenis.omx.decorators, org.molgenis.omx.observ, org.molgenis.omx.observ.db, org.molgenis.omx.observ.target, org.molgenis.omx.observ.target.db, org.molgenis.omx.observ.target.ui, org.molgenis.omx.observ.ui, org.molgenis.omx.observ.value, org.molgenis.omx.observ.value.db, org.molgenis.omx.observ.value.ui, org.molgenis.omx.protocol, org.molgenis.omx.services, org.molgenis.omx.utils, org.molgenis.service

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • org.molgenis.util.AbstractEntity (implements org.molgenis.util.Entity, java.io.Serializable)
    • org.molgenis.omx.observ.Characteristic (implements org.molgenis.omx.core.Identifiable)
      • org.molgenis.omx.observ.Category
      • org.molgenis.omx.observ.DataSet
      • org.molgenis.omx.observ.ObservableFeature
      • org.molgenis.omx.observ.ObservationTarget
        • org.molgenis.omx.observ.target.Individual
        • org.molgenis.omx.observ.target.Panel
      • org.molgenis.omx.observ.target.OntologyTerm
        • org.molgenis.omx.observ.target.Accession
        • org.molgenis.omx.observ.target.Species
      • org.molgenis.omx.observ.Protocol
    • org.molgenis.omx.core.MolgenisEntity (implements org.molgenis.omx.core.Autoid)
    • org.molgenis.omx.core.MolgenisFile (implements org.molgenis.omx.core.Identifiable)
    • org.molgenis.omx.observ.value.MrefValue_Value
    • org.molgenis.omx.observ.ObservationSet (implements org.molgenis.omx.core.Autoid)
    • org.molgenis.omx.observ.ObservedValue (implements org.molgenis.omx.core.Autoid)
    • org.molgenis.omx.observ.target.Ontology (implements org.molgenis.omx.core.Identifiable)
    • org.molgenis.omx.observ.target.Panel_Individuals
    • org.molgenis.omx.observ.target.PanelSource (implements org.molgenis.omx.core.Autoid)
    • org.molgenis.omx.observ.Protocol_Features
    • org.molgenis.omx.observ.Protocol_Subprotocols
    • org.molgenis.omx.core.RuntimeProperty (implements org.molgenis.omx.core.Identifiable)
    • org.molgenis.omx.observ.value.Value (implements org.molgenis.omx.core.Autoid)
      • org.molgenis.omx.observ.value.BoolValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.CategoricalValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.DateTimeValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.DateValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.DecimalValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.EmailValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.HtmlValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.HyperlinkValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.IntValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.LongValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.MrefValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.StringValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.TextValue
      • org.molgenis.omx.observ.value.XrefValue
  • org.molgenis.framework.ui.html.AbstractHtmlElement (implements org.molgenis.framework.ui.html.HtmlElement, org.molgenis.framework.ui.ScreenView)
    • org.molgenis.framework.ui.html.HtmlInput<E> (implements org.molgenis.framework.ui.html.HtmlElement, org.molgenis.framework.ui.html.Input<E>)
      • org.molgenis.framework.ui.html.HtmlWidget
        • org.molgenis.framework.ui.html.HtmlForm
          • org.molgenis.framework.ui.html.EntityForm<E>
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.AccessionForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.BoolValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.CategoricalValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.CategoryForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.CharacteristicForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.DataSetForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.DateTimeValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.DateValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.DecimalValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.EmailValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.HtmlValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.HyperlinkValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.IndividualForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.IntValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.LongValueForm
            • org.molgenis.omx.core.ui.MolgenisEntityForm
            • org.molgenis.omx.core.ui.MolgenisFileForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.MrefValue_ValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.MrefValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.ObservableFeatureForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.ObservationSetForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.ObservationTargetForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.ObservedValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.OntologyForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.OntologyTermForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.Panel_IndividualsForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.PanelForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.PanelSourceForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.Protocol_FeaturesForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.Protocol_SubprotocolsForm
            • org.molgenis.omx.observ.ui.ProtocolForm
            • org.molgenis.omx.core.ui.RuntimePropertyForm
            • org.molgenis.omx.observ.target.ui.SpeciesForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.StringValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.TextValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.ValueForm
            • org.molgenis.omx.observ.value.ui.XrefValueForm
  • org.molgenis.framework.db.AbstractMapper<E> (implements org.molgenis.framework.db.Mapper<E>)
    • org.molgenis.framework.db.jpa.AbstractJpaMapper<E>
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.AccessionJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.BoolValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.CategoricalValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.CategoryJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.CharacteristicJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.DataSetJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateTimeValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.DecimalValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.EmailValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.HtmlValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.HyperlinkValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.IndividualJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.IntValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.LongValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisEntityJpaMapper
      • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisFileJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValue_ValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.ObservableFeatureJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationSetJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationTargetJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.ObservedValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyTermJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.Panel_IndividualsJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSourceJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.Protocol_FeaturesJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.Protocol_SubprotocolsJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.db.ProtocolJpaMapper
      • org.molgenis.omx.core.db.RuntimePropertyJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.target.db.SpeciesJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.StringValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.TextValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.ValueJpaMapper
      • org.molgenis.omx.observ.value.db.XrefValueJpaMapper
  • org.molgenis.framework.tupletable.AbstractTupleTable (implements org.molgenis.framework.tupletable.TupleTable)
    • org.molgenis.framework.tupletable.AbstractFilterableTupleTable (implements org.molgenis.framework.tupletable.FilterableTupleTable)
      • org.molgenis.omx.dataset.DataSetTable (implements org.molgenis.framework.tupletable.DatabaseTupleTable)
      • org.molgenis.omx.protocol.ProtocolTable (implements org.molgenis.framework.tupletable.DatabaseTupleTable)
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.AccessionEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.AccessionService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.BoolValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.BoolValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.CategoricalValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.CategoricalValueService
  • org.molgenis.omx.observ.db.CategoryEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.CategoryService
  • org.molgenis.omx.observ.db.CharacteristicEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.CharacteristicService
  • org.molgenis.omx.observ.db.DataSetEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.DataSetService
  • org.molgenis.omx.dataset.DataSetTableIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateTimeValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.DateTimeValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.DateValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.DecimalValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.DecimalValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.EmailValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.EmailValueService
  • org.molgenis.omx.services.FileDownloadService (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisService)
  • org.molgenis.omx.services.FileUploadService (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisService)
  • org.molgenis.omx.services.FileUploadUtils
  • org.molgenis.omx.services.FileViewService (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisService)
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.HtmlValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.HtmlValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.HyperlinkValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.HyperlinkValueService
  • org.molgenis.omx.utils.I18nTools
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.IndividualEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.IndividualService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.IntValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.IntValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.LongValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.LongValueService
  • org.molgenis.framework.db.MapperDecorator<E> (implements org.molgenis.framework.db.Mapper<E>)
    • org.molgenis.omx.decorators.EmailValueDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.decorators.HyperlinkValueDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.decorators.MolgenisFileDecorator<E>
  • org.molgenis.omx.MolgenisDbSettings (implements org.molgenis.framework.server.MolgenisSettings)
  • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisEntityEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisFileEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.MolgenisFileService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValue_ValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.MrefValueService
  • org.molgenis.omx.decorators.NameConvention
  • org.molgenis.omx.observ.db.ObservableFeatureEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ObservableFeatureService
  • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationSetEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ObservationSetService
  • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationTargetEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ObservationTargetService
  • org.molgenis.omx.observ.db.ObservedValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ObservedValueService
  • org.molgenis.omx.OmxConfig
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.OntologyService
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyTermEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.OntologyTermService
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.Panel_IndividualsEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.PanelService
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSourceEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.PanelSourceService
  • org.molgenis.omx.observ.db.Protocol_FeaturesEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.observ.db.Protocol_SubprotocolsEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.observ.db.ProtocolEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ProtocolService
  • org.molgenis.omx.utils.ProtocolUtils
  • org.molgenis.omx.services.Report
  • org.molgenis.omx.core.db.RuntimePropertyEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.RuntimePropertyService
  • org.molgenis.omx.cart.ShoppingCartController
  • org.molgenis.omx.observ.target.db.SpeciesEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.SpeciesService
  • org.molgenis.omx.services.StorageHandler
    • org.molgenis.omx.decorators.MolgenisFileHandler
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.StringValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.StringValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.TextValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.TextValueService
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • org.molgenis.omx.decorators.MolgenisFileHandler.TypeUnknownException
      • org.molgenis.omx.converters.ValueConverterException
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToBoolValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToCategoricalValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToDateTimeValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToDateValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToDecimalValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToEmailValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToHtmlValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToHyperlinkValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToIntValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToLongValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToMrefValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToStringValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToTextValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.converters.TupleToXrefValueConverter (implements org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>)
  • org.molgenis.omx.utils.ValueCell<T> (implements org.molgenis.util.tuple.Cell<T>)
  • org.molgenis.omx.converters.ValueConverter
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.ValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ValueService
  • org.molgenis.omx.observ.value.db.XrefValueEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.XrefValueService

Interface Hierarchy

• org.molgenis.util.Entity
  • org.molgenis.omx.core.Autoid
    • org.molgenis.omx.core.Identifiable
  • org.molgenis.omx.core.Identifiable
• org.molgenis.omx.converters.TupleToValueConverter<S,T>