Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• org.molgenis.omx.auth.db,
• org.molgenis.omx.core.db,
• org.molgenis.omx.das,
• org.molgenis.omx.observ.db,
• org.molgenis.omx.observ.target.db,
• org.molgenis.omx.observ.value.db,
• org.molgenis.omx.patient,
• org.molgenis.omx.patient.db,
• org.molgenis.omx.xgap,
• org.molgenis.omx.xgap.db,
• org.molgenis.service

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • org.molgenis.util.AbstractEntity (implements org.molgenis.util.Entity, java.io.Serializable)
    • org.molgenis.omx.observ.Characteristic (implements org.molgenis.omx.core.Identifiable)
      • org.molgenis.omx.observ.ObservationTarget
        • org.molgenis.omx.xgap.Chromosome
        • org.molgenis.omx.xgap.Clone (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
        • org.molgenis.omx.xgap.DerivedTrait
        • org.molgenis.omx.xgap.EnvironmentalFactor
        • org.molgenis.omx.xgap.Gene (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
        • org.molgenis.omx.observ.target.Individual
          • org.molgenis.omx.patient.Patient
        • org.molgenis.omx.xgap.Marker (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
          • org.molgenis.omx.xgap.SNP
        • org.molgenis.omx.xgap.MassPeak
        • org.molgenis.omx.xgap.Metabolite
        • org.molgenis.omx.xgap.NMRBin
        • org.molgenis.omx.xgap.PairedSample
        • org.molgenis.omx.xgap.Polymorphism
        • org.molgenis.omx.xgap.Probe (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
          • org.molgenis.omx.xgap.Spot
        • org.molgenis.omx.xgap.ProbeSet (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
        • org.molgenis.omx.xgap.Protein
        • org.molgenis.omx.xgap.Sample
        • org.molgenis.omx.xgap.Transcript
        • org.molgenis.omx.xgap.Variant (implements org.molgenis.omx.xgap.Locus)
      • org.molgenis.omx.xgap.Track
    • org.molgenis.omx.xgap.Marker_ReportsFor
    • org.molgenis.omx.xgap.SNP_Polymorphism
  • org.molgenis.framework.db.AbstractMapper<E> (implements org.molgenis.framework.db.Mapper<E>)
    • org.molgenis.framework.db.jpa.AbstractJpaMapper<E>
      • org.molgenis.omx.xgap.db.ChromosomeJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.CloneJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.DerivedTraitJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.EnvironmentalFactorJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.GeneJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.Marker_ReportsForJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.MarkerJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.MassPeakJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.MetaboliteJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.NMRBinJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.PairedSampleJpaMapper
      • org.molgenis.omx.patient.db.PatientJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.PolymorphismJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeSetJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.ProteinJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.SampleJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.SNP_PolymorphismJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.SNPJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.SpotJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.TrackJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.TranscriptJpaMapper
      • org.molgenis.omx.xgap.db.VariantJpaMapper
  • org.molgenis.omx.xgap.db.ChromosomeEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ChromosomeService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.CloneEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.CloneService
  • org.molgenis.omx.das.DasOmxDataSource (implements uk.ac.ebi.mydas.datasource.RangeHandlingAnnotationDataSource)
  • org.molgenis.omx.das.DasPatientFilter (implements javax.servlet.Filter)
  • uk.ac.ebi.mydas.model.DasTarget (implements java.io.Serializable)
    • org.molgenis.omx.das.MolgenisDasTarget
  • org.molgenis.omx.xgap.db.DerivedTraitEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.DerivedTraitService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.EnvironmentalFactorEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.EnvironmentalFactorService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.GeneEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.GeneService
  • org.molgenis.framework.db.MapperDecorator<E> (implements org.molgenis.framework.db.Mapper<E>)
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.AccessionSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.BoolValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.CategoricalValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.CategorySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.CharacteristicSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.ChromosomeSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.CloneSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.DataSetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateTimeValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DateValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.DecimalValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.DerivedTraitSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.EmailValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.EnvironmentalFactorSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.GeneSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.HtmlValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.HyperlinkValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.IndividualSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.InstituteSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.IntValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.LongValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.Marker_ReportsForSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.MarkerSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.MassPeakSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.MetaboliteSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisEntitySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.MolgenisFileSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.MrefValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.NMRBinSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservableFeatureSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationSetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservationTargetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ObservedValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.OntologyTermSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.PairedSampleSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.PanelSourceSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.patient.db.PatientSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.PersonRoleSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.auth.db.PersonSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.PolymorphismSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeSetSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.ProteinSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.db.ProtocolSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.core.db.RuntimePropertySecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.SampleSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.SNP_PolymorphismSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.SNPSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.target.db.SpeciesSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.SpotSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.StringValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.TextValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.TrackSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.TranscriptSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.ValueSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.xgap.db.VariantSecurityDecorator<E>
    • org.molgenis.omx.observ.value.db.XrefValueSecurityDecorator<E>
  • org.molgenis.omx.xgap.db.Marker_ReportsForEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.xgap.db.MarkerEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.MarkerService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.MassPeakEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.MassPeakService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.MetaboliteEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.MetaboliteService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.NMRBinEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.NMRBinService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.PairedSampleEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.PairedSampleService
  • org.molgenis.omx.patient.db.PatientEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.PatientService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.PolymorphismEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.PolymorphismService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ProbeService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.ProbeSetEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ProbeSetService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.ProteinEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.ProteinService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.SampleEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.SampleService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.SNP_PolymorphismEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.omx.xgap.db.SNPEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.SNPService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.SpotEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.SpotService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.TrackEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.TrackService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.TranscriptEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.TranscriptService
  • org.molgenis.omx.xgap.db.VariantEntityImporter (implements org.molgenis.framework.db.EntityImporter)
  • org.molgenis.service.VariantService
  • org.molgenis.omx.das.WebAppInitializer (implements org.springframework.web.WebApplicationInitializer)

Interface Hierarchy

• org.molgenis.util.Entity
  • org.molgenis.omx.xgap.Locus