org.seqdoop.hadoop_bam.util

Classes

• BGZFBlockIndex
• BGZFBlockIndexer
• BGZFCodec
• BGZFEnhancedGzipCodec
• BGZFSplitFileInputFormat
• BGZFSplitGuesser
• ConfHelper
• DataInputWrapper
• DataOutputWrapper
• GetSortedBAMHeader
• MurmurHash3
• NIOFileUtil
• Pair
• SAMFileMerger
• SAMHeaderReader
• SAMOutputPreparer
• SeekableArrayStream
• Timer
• VCFFileMerger
• VCFHeaderReader
• WrapSeekable