public class Parser extends Object
| Modifier and Type | Class and Description |
|---|---|
protected static class |
Parser.Ctx
命名约定：0 - 表示起点，包含；1 - 表示终点，不含；
|
protected static class |
Parser.G |
| Modifier and Type | Field and Description |
|---|---|
protected static Exon |
DealText |
protected static org.slf4j.Logger |
logger |
protected static int |
RegxFlag |
protected static Exon |
SkipThis |
| Constructor and Description |
|---|
Parser() |
| Modifier and Type | Method and Description |
|---|---|
protected static Exon |
dealDnaBkb(Parser.Ctx ctx)
处理DNA:BKB，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealDnaEnd(Parser.Ctx ctx)
处理DNA:END，并决定是否停止后续处理
|
protected static @NotNull Exon |
dealDnaGroup(Parser.Ctx ctx)
处理 DNA 组
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protected static Exon |
dealDnaRaw(Parser.Ctx ctx)
处理DNA:RAW，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealDnaSet(Parser.Ctx ctx)
处理DNA:SET，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaDone(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:DONE，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaEach(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:EACH，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaElse(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:ELSE，并决定是否停止后续处理
|
protected static @NotNull Exon |
dealRnaGroup(Parser.Ctx ctx)
处理 RNA 组
|
protected static Exon |
dealRnaPut(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:PUT，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaRun(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:RUN，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaUse(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:USE，并决定是否停止后续处理
|
protected static Exon |
dealRnaWhen(Parser.Ctx ctx)
处理RNA:WHEN，并决定是否停止后续处理
|
protected static void |
dealTxtPlain(Parser.Ctx ctx,
int edge0,
Exon exon)
处理普通文本
|
protected static boolean |
findXnaGrp(Parser.Ctx ctx,
String token)
查找`DNA:`或`RNA:`，并返回查找到的3个值
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protected static boolean |
markHiMeepo(Parser.Ctx ctx)
查找并处理meepo，是否停止后续处理
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static Gene |
parse(String txt)
解析文本，严格模式。
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static Gene |
parse(String txt,
boolean lax)
解析文本。发现指令的语法错误时，有放松模式（日志warn，并视为普通文本）和严格模式（抛异常）
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protected static final org.slf4j.Logger logger
protected static final Exon SkipThis
protected static final Exon DealText
protected static final int RegxFlag
public static Gene parse(String txt, boolean lax)
txt - 文本lax - 放松模式@NotNull protected static @NotNull Exon dealDnaGroup(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文@NotNull protected static @NotNull Exon dealRnaGroup(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static boolean markHiMeepo(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static void dealTxtPlain(Parser.Ctx ctx, int edge0, Exon exon)
ctx - 上下文edge0 - 左边缘exon - exonprotected static boolean findXnaGrp(Parser.Ctx ctx, String token)
ctx - 上下文token - 特征protected static Exon dealDnaRaw(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealDnaBkb(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealDnaEnd(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealDnaSet(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaRun(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaUse(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaPut(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaWhen(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaEach(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaElse(Parser.Ctx ctx)
ctx - 上下文protected static Exon dealRnaDone(Parser.Ctx ctx)
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